메타게놈 다음 간 병원체 검출 일관성 비교

Scientific Reports 13권, 기사 번호: 9460(2023) 이 기사 인용

측정항목 세부정보

메타게놈 차세대 시퀀싱(mNGS)의 적용은 임상 실무자에 의해 점차적으로 수행되었습니다. 그러나 혈류 감염이 의심되는 환자의 혈액 배양과 이를 비교한 연구는 거의 없습니다. 본 연구의 목적은 혈류 감염이 의심되는 환자에서 이 두 가지 분석법을 통해 병원성 미생물의 검출을 비교하는 것이었습니다. 우리는 2020년 1월부터 2022년 6월까지 발열, 오한, 3일 이상 항생제 사용, 혈류감염 의심, 루이진병원 응급실 입원 등의 증상이 있었던 환자들을 후향적으로 연구했다. 혈액 배양. 임상 및 실험실 매개변수는 혈액을 채취한 날 수집되었습니다. 두 가지 방법에 의한 병원성 미생물 검출을 비교하였다. 혈류 감염 환자의 위험 요인과 병원 내 사망률은 이 두 가지 분석에 대해 별도로 분석되었습니다. 99명의 환자 모두에서 혈액 mNGS의 병원성 미생물 검출률은 혈액 배양의 병원성 미생물 검출률보다 유의하게 높았습니다. 혈액 mNGS는 모든 양성 세균 및 진균 검사 결과 중 단 12.00%에서만 혈액 배양과 일치했습니다. CRP 수준은 혈액 mNGS에 의해 검출된 균혈증, 곰팡이혈증 및 바이러스혈증과 관련이 있습니다. 혈액배양이 양성인 환자에서는 명확한 위험인자를 찾을 수 없습니다. 중병 환자의 경우 두 가지 테스트 모두 환자 결과를 개선하지 못했습니다. 혈류 감염이 의심되는 환자의 경우 mNGS는 아직 혈액 배양을 완전히 대체할 수 없습니다.

혈류감염(BSI)은 병원체가 혈류에 침입하여 혈액과 함께 퍼지는 감염으로, BSI는 균혈증, 진균혈증, 바이러스혈증으로 나타날 수 있습니다. 심할 경우 패혈증으로 발전해 쇼크, 파종성 혈관내 응고, 다발성 장기부전 등을 일으킬 수 있는 전신 감염질환이다. BSI 발병률은 인구 100,000명당 113~204이며1,2 매년 증가하고 있습니다3,4. 혈류감염은 치명률이 높고, 입원 시간을 연장시키며, 입원 비용을 증가시키고, 심각한 피해를 초래합니다2,5,6. 따라서 예방과 더불어 병원체의 조기발견에 대한 관심도 높아지고 있다.

전통적인 혈액배양과 비교하여, 메타게놈 차세대 염기서열분석(mNGS)은 고처리량 염기서열분석을 통해 병원성 미생물을 진단하는데 있어 범위가 넓고 속도가 빠르며 배양이 필요 없다는 장점이 있습니다7. 그러나 혈류 감염에 대한 사용은 높은 가격으로 인해 대중화되지 않았습니다. mNGS 및 혈액 배양 분석 결과를 조사한 연구는 거의 없습니다. 본 연구의 목적은 혈류 감염이 의심되는 환자에서 이 두 가지 분석법을 통해 병원성 미생물의 검출을 비교하는 것이었습니다.

우리는 2020년 1월부터 2022년 6월까지 루이진병원 응급실에 입원한 혈류감염이 의심되는 환자들을 후향적으로 연구했다.

포함 기준은 다음과 같다: 모든 환자는 16세 이상이었고, 최고 체온이 38.5°C 이상이었고, 오한이 있었고, 3일 이상 항생제를 사용했다. 혈액 mNGS 검사는 혈액 배양 채취 당일에 수행되었습니다. 이 연구는 Shanghai Jiao Tong University School of Medicine 산하 Ruijin 병원 윤리위원회의 승인을 받았으며 사전 동의를 포기했습니다. 데이터 분석은 "1964년 헬싱키 선언" 및 이후 개정판 또는 이에 상응하는 윤리 표준에 규정된 윤리 표준에 따라 수행되었습니다.

무균 방법을 사용하여 환자의 서로 다른 두 부분에서 일련의 호기성 및 혐기성 병 혈액 샘플을 수집하고 체온이 ≥ 38.5 °C일 때 5~7일 동안 배양했습니다. 각 병의 혈액 채취량은 약 5~10ml였습니다. 혈액 배양은 임상 미생물학의 표준 운영 절차에 따라 수행되었습니다. 사용된 전자동 혈액배양 장치는 BACTECFX(Becton, Dickinson and Company, US)였다. 세균 식별은 VITEK MS 검출 시스템(BioMérieux, Marcyl'Étoile, France)을 사용하여 수행되었습니다. 혈액배양 양성은 혈액 내 박테리아나 진균과 같은 특정 병원체가 검출되는 것으로 정의되었으며, 음성 혈액배양은 잠복기 동안 어떤 유기체도 자라지 않는 것으로 정의되었습니다. 혈액 배양이 오염된 것으로 간주되는지 여부는 두 명의 부주치의가 정의했습니다.